Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pag1Q3U1F9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pag1Q3U1F9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms