Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccdc174Q3U155 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc174Q3U155 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms