Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXS7

Psmd1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd1Q3TXS7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd1Q3TXS7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Psmd1Q3TXS7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Psmd1Q3TXS7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms