Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ccndbp1Q3TVC7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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