Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
D17Wsu92eQ3TT38 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
D17Wsu92eQ3TT38 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms