Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ctdnep1Q3TP92 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ctdnep1Q3TP92 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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