Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
H2afvQ3THW5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
H2afvQ3THW5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms