Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem248Q3TBN1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem248Q3TBN1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms