Protein–RNA interactions for Protein: Q3TB48

Tmem104, Transmembrane protein 104, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem104Q3TB48 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem104Q3TB48 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem104Q3TB48 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms