Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hddc2Q3SXD3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Hddc2Q3SXD3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms