Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zbtb38Q3LR78 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zbtb38Q3LR78 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms