Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riiad1Q3KNY5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Riiad1Q3KNY5 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Riiad1Q3KNY5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Riiad1Q3KNY5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms