Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Hdgfl1Q2VPR5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms