Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam178bQ24JP3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam178bQ24JP3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam178bQ24JP3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
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