Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Spatc1Q148B6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
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Spatc1Q148B6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Spatc1Q148B6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Spatc1Q148B6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms