Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG18

Smim24, Small integral membrane protein 24, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim24Q0VG18 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smim24Q0VG18 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Smim24Q0VG18 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms