Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rundc1Q0VDN7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rundc1Q0VDN7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rundc1Q0VDN7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms