Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBL1

Tigd2, Tigger transposable element-derived protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd2Q0VBL1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tigd2Q0VBL1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tigd2Q0VBL1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms