Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
StumQ0VBF8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
StumQ0VBF8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms