Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tmem52bQ0VBF2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem52bQ0VBF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms