Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TrioQ0KL02 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TrioQ0KL02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TrioQ0KL02 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms