Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cnnm1Q0GA42 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cnnm1Q0GA42 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cnnm1Q0GA42 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms