Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gdf3Q07104 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gdf3Q07104 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms