Protein–RNA interactions for Protein: Q06806

Tie1, Tyrosine-protein kinase receptor Tie-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tie1Q06806 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tie1Q06806 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tie1Q06806 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms