Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cab39Q06138 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cab39Q06138 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms