Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Top1Q04750 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Top1Q04750 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms