Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Emx2Q04744 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Emx2Q04744 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms