Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nf1Q04690 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nf1Q04690 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nf1Q04690 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nf1Q04690 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nf1Q04690 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nf1Q04690 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nf1Q04690 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nf1Q04690 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms