Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Fgfr4Q03142 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Fgfr4Q03142 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fgfr4Q03142 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms