Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Col6a2Q02788 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Col6a2Q02788 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Col6a2Q02788 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms