Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ly9Q01965 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ly9Q01965 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms