Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Nme2Q01768 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Nme2Q01768 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms