Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gbp1Q01514 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gbp1Q01514 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms