Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SelpQ01102 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SelpQ01102 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SelpQ01102 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms