Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
PrcdQ00LT2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
PrcdQ00LT2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms