Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rbp4Q00724 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rbp4Q00724 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms