Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SeleQ00690 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SeleQ00690 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms