Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
F8a1Q00558 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
F8a1Q00558 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms