Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GabpaQ00422 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabpaQ00422 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms