Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PgrQ00175 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PgrQ00175 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PgrQ00175 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PgrQ00175 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms