Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psmb4P99026 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psmb4P99026 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms