Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scn1bP97952 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Scn1bP97952 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms