Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cry1P97784 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cry1P97784 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms