Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pitx2P97474 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pitx2P97474 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms