Protein–RNA interactions for Protein: P97458

Prop1, Homeobox protein prophet of Pit-1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prop1P97458 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prop1P97458 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prop1P97458 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prop1P97458 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prop1P97458 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prop1P97458 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Prop1P97458 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms