Protein–RNA interactions for Protein: P97436

Nkx3-1, Homeobox protein Nkx-3.1, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-1P97436 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nkx3-1P97436 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx3-1P97436 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms