Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Meis3P97368 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Meis3P97368 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Meis3P97368 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms