Protein–RNA interactions for Protein: P97355

Sms, Spermine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmsP97355 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SmsP97355 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SmsP97355 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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SmsP97355 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SmsP97355 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SmsP97355 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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SmsP97355 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmsP97355 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SmsP97355 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SmsP97355 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SmsP97355 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmsP97355 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SmsP97355 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SmsP97355 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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SmsP97355 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmsP97355 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmsP97355 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SmsP97355 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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SmsP97355 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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SmsP97355 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SmsP97355 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms