Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arf1P84078 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Arf1P84078 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arf1P84078 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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