Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tubg1P83887 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tubg1P83887 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms